Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox8Q04886 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sox8Q04886 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sox8Q04886 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sox8Q04886 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox8Q04886 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox8Q04886 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sox8Q04886 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms