Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelbQ04863 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelbQ04863 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RelbQ04863 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RelbQ04863 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RelbQ04863 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RelbQ04863 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RelbQ04863 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RelbQ04863 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RelbQ04863 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelbQ04863 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelbQ04863 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelbQ04863 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms