Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdk16Q04735 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms