Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcr5Q04683 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms