Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Smpd1Q04519 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms