Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RelaQ04207 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RelaQ04207 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RelaQ04207 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RelaQ04207 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RelaQ04207 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RelaQ04207 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RelaQ04207 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RelaQ04207 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms