Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thbs2Q03350 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thbs2Q03350 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms