Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms