Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddr1Q03146 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms