Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gjb5Q02739 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb5Q02739 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms