Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms