Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmgcrQ01237 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmgcrQ01237 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms