Protein–RNA interactions for Protein: Q01147

Creb1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb1Q01147 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb1Q01147 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb1Q01147 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb1Q01147 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb1Q01147 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb1Q01147 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb1Q01147 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb1Q01147 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb1Q01147 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb1Q01147 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb1Q01147 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb1Q01147 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Creb1Q01147 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Creb1Q01147 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Creb1Q01147 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Creb1Q01147 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Creb1Q01147 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Creb1Q01147 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Creb1Q01147 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms