Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SelpQ01102 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SelpQ01102 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SelpQ01102 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SelpQ01102 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SelpQ01102 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SelpQ01102 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SelpQ01102 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SelpQ01102 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SelpQ01102 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SelpQ01102 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SelpQ01102 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SelpQ01102 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms