Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grin2cQ01098 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms