Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Grin2bQ01097 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Grin2bQ01097 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms