Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col8a1Q00780 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col8a1Q00780 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms