Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VegfaQ00731 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms