Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx2Q00262 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms