Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab33aP97950 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab33aP97950 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab33aP97950 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms