Protein–RNA interactions for Protein: P97864

Casp7, Caspase-7, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp7P97864 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp7P97864 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp7P97864 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp7P97864 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casp7P97864 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casp7P97864 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp7P97864 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp7P97864 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp7P97864 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp7P97864 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp7P97864 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms