Protein–RNA interactions for Protein: P97817

Cdr2, Cerebellar degeneration-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2P97817 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdr2P97817 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr2P97817 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdr2P97817 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdr2P97817 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2P97817 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2P97817 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2P97817 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2P97817 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2P97817 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2P97817 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2P97817 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2P97817 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2P97817 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2P97817 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2P97817 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2P97817 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2P97817 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2P97817 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2P97817 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2P97817 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2P97817 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2P97817 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2P97817 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2P97817 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2P97817 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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