Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra1P97785 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra1P97785 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms