Protein–RNA interactions for Protein: P97766

Cfc1, Cryptic protein, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfc1P97766 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cfc1P97766 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfc1P97766 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms