Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smyd1P97443 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd1P97443 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd1P97443 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd1P97443 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd1P97443 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd1P97443 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd1P97443 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd1P97443 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd1P97443 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd1P97443 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd1P97443 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd1P97443 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd1P97443 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd1P97443 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd1P97443 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd1P97443 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd1P97443 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd1P97443 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd1P97443 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd1P97443 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd1P97443 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd1P97443 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd1P97443 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd1P97443 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd1P97443 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smyd1P97443 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smyd1P97443 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smyd1P97443 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smyd1P97443 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smyd1P97443 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Smyd1P97443 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smyd1P97443 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smyd1P97443 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smyd1P97443 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smyd1P97443 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smyd1P97443 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smyd1P97443 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smyd1P97443 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smyd1P97443 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms