Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1b3P97370 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1b3P97370 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms