Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim43cP86449 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms