Protein–RNA interactions for Protein: P81270

Erg, Transcriptional regulator ERG, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErgP81270 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ErgP81270 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ErgP81270 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ErgP81270 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ErgP81270 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ErgP81270 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ErgP81270 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ErgP81270 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ErgP81270 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ErgP81270 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErgP81270 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErgP81270 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErgP81270 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ErgP81270 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ErgP81270 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErgP81270 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErgP81270 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErgP81270 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErgP81270 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErgP81270 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErgP81270 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErgP81270 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErgP81270 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ErgP81270 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ErgP81270 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ErgP81270 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ErgP81270 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ErgP81270 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ErgP81270 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ErgP81270 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ErgP81270 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ErgP81270 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ErgP81270 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ErgP81270 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ErgP81270 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ErgP81270 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ErgP81270 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ErgP81270 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ErgP81270 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ErgP81270 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ErgP81270 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ErgP81270 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ErgP81270 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ErgP81270 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ErgP81270 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ErgP81270 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ErgP81270 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ErgP81270 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ErgP81270 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ErgP81270 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ErgP81270 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ErgP81270 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ErgP81270 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ErgP81270 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ErgP81270 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ErgP81270 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ErgP81270 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ErgP81270 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ErgP81270 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ErgP81270 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ErgP81270 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ErgP81270 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ErgP81270 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ErgP81270 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ErgP81270 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ErgP81270 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ErgP81270 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ErgP81270 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErgP81270 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErgP81270 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErgP81270 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErgP81270 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ErgP81270 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErgP81270 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ErgP81270 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ErgP81270 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ErgP81270 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ErgP81270 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ErgP81270 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ErgP81270 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ErgP81270 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ErgP81270 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ErgP81270 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErgP81270 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms