Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabpb2P81069 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabpb2P81069 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms