Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sparcl1P70663 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sparcl1P70663 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms