Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ldb1P70662 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldb1P70662 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms