Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tp53bp1P70399 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tp53bp1P70399 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms