Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp9xP70398 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp9xP70398 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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