Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeboxP70368 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeboxP70368 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SeboxP70368 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeboxP70368 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SeboxP70368 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeboxP70368 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SeboxP70368 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SeboxP70368 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms