Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxb13P70321 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxb13P70321 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms