Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprvP70289 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprvP70289 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprvP70289 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprvP70289 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprvP70289 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprvP70289 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprvP70289 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprvP70289 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprvP70289 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprvP70289 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprvP70289 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprvP70289 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprvP70289 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprvP70289 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms