Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sycp3P70281 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sycp3P70281 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sycp3P70281 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms