Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stra8P70278 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stra8P70278 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stra8P70278 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Stra8P70278 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Stra8P70278 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Stra8P70278 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms