Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkn1P70268 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkn1P70268 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkn1P70268 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms