Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chl1P70232 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chl1P70232 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chl1P70232 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chl1P70232 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chl1P70232 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chl1P70232 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chl1P70232 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chl1P70232 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chl1P70232 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chl1P70232 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chl1P70232 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chl1P70232 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms