Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf5P70191 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf5P70191 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf5P70191 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf5P70191 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Traf5P70191 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf5P70191 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf5P70191 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf5P70191 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf5P70191 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf5P70191 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf5P70191 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf5P70191 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf5P70191 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf5P70191 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 304 ms