Protein–RNA interactions for Protein: P63318

Prkcg, Protein kinase C gamma type, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcgP63318 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcgP63318 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcgP63318 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcgP63318 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcgP63318 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcgP63318 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcgP63318 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcgP63318 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcgP63318 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcgP63318 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcgP63318 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcgP63318 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcgP63318 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcgP63318 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcgP63318 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcgP63318 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms