Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgb1P63158 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hmgb1P63158 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms