Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp2P63044 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms