Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps3P62908 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rps3P62908 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps3P62908 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps3P62908 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps3P62908 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps3P62908 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps3P62908 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps3P62908 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps3P62908 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms