Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RhobP62746 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhobP62746 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhobP62746 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhobP62746 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhobP62746 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhobP62746 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhobP62746 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhobP62746 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhobP62746 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhobP62746 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhobP62746 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhobP62746 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhobP62746 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhobP62746 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhobP62746 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhobP62746 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhobP62746 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhobP62746 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhobP62746 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhobP62746 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhobP62746 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhobP62746 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhobP62746 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhobP62746 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhobP62746 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhobP62746 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhobP62746 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhobP62746 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhobP62746 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RhobP62746 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhobP62746 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhobP62746 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhobP62746 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhobP62746 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhobP62746 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhobP62746 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhobP62746 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RhobP62746 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RhobP62746 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhobP62746 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhobP62746 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhobP62746 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhobP62746 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhobP62746 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhobP62746 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhobP62746 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhobP62746 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhobP62746 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhobP62746 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhobP62746 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhobP62746 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhobP62746 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhobP62746 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhobP62746 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhobP62746 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhobP62746 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhobP62746 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhobP62746 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhobP62746 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhobP62746 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhobP62746 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhobP62746 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhobP62746 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RhobP62746 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhobP62746 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhobP62746 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhobP62746 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhobP62746 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhobP62746 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhobP62746 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhobP62746 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhobP62746 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhobP62746 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhobP62746 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhobP62746 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhobP62746 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhobP62746 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhobP62746 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhobP62746 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RhobP62746 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhobP62746 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms