Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11aP62492 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11aP62492 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms