Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lsm3P62311 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm3P62311 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms