Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps13P62301 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps13P62301 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps13P62301 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps13P62301 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps13P62301 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps13P62301 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps13P62301 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps13P62301 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps13P62301 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps13P62301 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps13P62301 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps13P62301 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps13P62301 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps13P62301 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms