Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CirbpP60824 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CirbpP60824 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CirbpP60824 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CirbpP60824 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CirbpP60824 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CirbpP60824 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CirbpP60824 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CirbpP60824 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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